En esta ocasión, Ajay vuelve a su tierra natal, Kyrat, para esparcir las cenizas de su madre, todo para encontrarse que este territorio está en conflicto y en medio de una guerra civil entre la resistencia y el tirano rey Pagan Min.
Ajay tendrá que elegir su bando y tomar decisiones que dictaran el destino de Kyrat, todo en medio de locaciones bien logradas, mucha fauna y, por supuesto, grandes dosis de acción.